通常為了節省成本，多數商家會使用地下水或是井水作為饅頭加工的原水，井水有腥氣不是大問題，因為這些揮發性的成分做出饅頭大多數已經揮發走了。真正的問題是地下水的硬度大，加工出的饅頭容易結一些硬的疙瘩（不溶于水的鈣鹽和鎂鹽）。

盡管目前我國自來水的出廠標準也是可直接飲用的，但是遠距離輸水，要考慮二次污染問題。所以為了增加饅頭的外觀以及口感，通常會使用反滲透設備進行處理，出水可達到純凈水的標準。具體的配置還是要根據原水的情況進行判別。