煤化工廢水處理主要是以脫氮除碳為目的，將有機氮轉化為氨氮，利用硝化細菌和反硝化細菌的作用，經過一系列的轉化從而達到從廢水中脫除的目的。

單獨釆用好氧或厭氧技術進行煤化工廢水處理并不能夠達到令人預期的結果，而厭氧-好氧的聯合生物處理技術逐漸引起重視。

煤化工廢水經過厭氧酸化處理后，廢水中有機物的生物降解性能顯著增加，使后續的好氧生物處理CODcr的除去率達90%以上。其中難降解有機物萘、喹啉和吡啶的降解率分別為65%、55%和70%以上，而一般的好氧處理對這些有機物的除去率不足20%。

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